Jednostka jest czynnym podatnikiem podatku od towarów, który wykonuje zarówno czynności opodatkowane jak i zwolnione od podatku. Z treści zapytania wynika, że w miesiącu listopadzie 2004 r. Podatnik zakupił nieruchomość, na którą składają się: grunt, budynek biurowy, budynek warsztatowy, drogi, place i inne budowle. Część zakupionej nieruchomości będzie przez Jednostkę wykorzystywana dla świadczenia usług opodatkowanych podatkiem od towarów i usług, pozostała część, zgodnie z opracowanym planem zagospodarowania, ma być przeznaczona na działalność objętą zwolnieniem od podatku VAT. Wobec powyższego Jednostka wystąpiła z zapytaniem czy postąpi prawidłowo, jeżeli dokona obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego wynikającą z tej części nabytej nieruchomości, która jest przeznaczona na działalność opodatkowaną VAT. Zgodnie z ogólną zasadą wyrażoną w art. 86 ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535) w zakresie, w jakim towary i usługi są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych, podatnikowi, o którym mowa w art. 15, przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego. W myśl natomiast art. 90 ust. 1 ustawy, w stosunku do towarów i usług, które są wykorzystywane przez podatnika do czynności, w związku z którymi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, jak i czynności, w związku z którymi takie prawo nie przysługuje, podatnik jest obowiązany do odrębnego określenia kwot podatku naliczonego związanych z czynnościami, w stosunku do których podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego. Dopiero jeżeli nie jest możliwe wyodrębnienie całości lub części kwot, o których mowa w ust. 1, podatnik może pomniejszyć kwotę podatku należnego o taką część kwoty podatku naliczonego, którą można przypisać czynnościom, w stosunku do których podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego na zasadach określonych w art. 90 ust. 2-10 ustawy. Jak wynika z opisu stanu faktycznego zawartego w zapytaniu, w rozpatrywanym przypadku jest możliwe określenie kwot, o których mowa w ww. przepisie art. 90 ust. 1 ustawy, w związku z czym nie jest konieczne zastosowanie trybu rozliczenia podatku przewidzianego w ust. 2-10 tego artykułu. Na podstawie dokonanej przez rzeczoznawcę majątkowego wyceny poszczególnych składników nieruchomości i planu zagospodarowania Jednostka ustaliła jaka część wartości nieruchomości i przypadająca od niej kwota podatku naliczonego jest związana z czynnościami, w stosunku do których przysługuje jej prawo do obniżenia kwoty podatku należnego. Wobec powyższego tut. organ stwierdza, że Jednostce przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego z faktury dokumentującej zakup nieruchomości na zasadach określonych w art. 90 ust. 1 w związku z art. 86 ust. 1 ustawy tj. w sposób przedstawiony w zapytaniu. Na podstawie art. 87 ust. 1 cytowanej ustawy, w przypadku gdy kwota podatku naliczonego, o której mowa w art. 86 ust. 2 jest w okresie rozliczeniowym wyższa od kwoty podatku należnego – podatnik ma prawo do obniżenia o tę kwotę kwoty podatku należnego za następne okresy lub do zwrotu różnicy podatku na rachunek bankowy. Stosownie do ust. 2 i 3 cytowanego art. 87 ustawy, kwota różnicy podatku odpowiadająca wartości podatku naliczonego, związanego z nabyciem towarów i usług, które na podstawie przepisów o podatku dochodowym są zaliczane przez podatnika do środków trwałych i wartości niematerialnych i prawnych podlegających amortyzacji podlega zwrotowi w terminie 60 dni od dnia złożenia rozliczenia przez podatnika. Z pisma Jednostki wynika, że elementy składowe nieruchomości będącej przedmiotem zakupu zostały przyjęte na ewidencję środków trwałych i będą amortyzowane. Wobec powyższego kwota różnicy podatku odpowiadająca wartości podatku naliczonego związanego z nabyciem nieruchomości (w części podlegającej odliczeniu) podlega zwrotowi na rachunek bankowy Podatnika w terminie 60 dni od dnia złożenia rozliczenia - na podstawie ww. art. 87 ust. 2 i 3 omawianej ustawy o podatku od towarów i usług z dnia 11.03.2004r.