Z powyższego pisma oraz załączonych umów wynika, iż Gmina jako beneficjent zawarła z Agencją Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa z/s w Warszawie umowy określające warunki i tryb udzielenia pomocy z funduszu Unii Europejskiej i funduszy krajowych – Program SAPARD.Gmina podpisała:

1. w dniu 06.05.2004 r. umowę zobowiązującą do realizacji inwestycji polegającej na „ budowie zbiornika retencyjnego i rurociągów technologicznych dla potrzeb stacji uzdatniania wody oraz budowie sieci wodociągowej z przyłączami”,
2. w dniu 26.06.2004 r. umowę zobowiązującą do realizacji inwestycji polegającej na „ budowie kanalizacji sanitarnej we wsiach ...”,
3. w dniu 26.06.2004 r. umowę zobowiązującą do realizacji inwestycji polegającej na „ budowie drogi relacji ...”,

Ze stanu faktycznego przedstawionego przez podatnika wynika, iż Urząd jest podatnikiem podatku od towarów i usług w zakresie:

dostaw wody dla mieszkańców gminy, wynajmu pomieszczeń biurowych i garażowych, usług kserograficznych, specyfikacji istotnych warunków zamówienia, organizacji szkoleń z zakresu administracji.

Analizując umowę pierwszą stwierdzić należy, że jest ona związana z zaopatrzeniem gospodarstw wiejskich w wodę, zatem zakupy związane z tą inwestycją są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych tj. dostawą wody dla mieszkańców Gminy.

Zatem Gminie na podstawie art. 86 ust.1 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535) przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego związanego z tą inwestycją, polegającą na „budowie zbiornika retencyjnego i rurociągów technologicznych dla potrzeb stacji uzdatniania wody oraz budowie sieci wodociągowej z przyłączami”. W pozostałych przypadkach brak jest związku nabywanych przez beneficjenta towarów i usług na powyższe inwestycje ze sprzedażą opodatkowaną, jak również brak jest możliwości skompensowania tego podatku w postaci zmniejszenia swoich zobowiązań z tytułu podatku dochodowego od osób prawnych, ponieważ w myśl art. 6 ust.1 pkt 6 ustawy z dnia 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowego od osób prawnych ( tekst jed. Dz. U. z 2000 r. Nr 54, poz. 654 ze zm.) podatnik (beneficjent) jako jednostka samorządu terytorialnego, zwolniony jest od tego podatku.

W świetle powyższego zdaniem tut. organu podatkowego podatek VAT zawarty w zakupach dot. inwestycji polegających na:- budowie kanalizacji sanitarnej we wsi ...”,- budowie drogi ,nie podlega zarówno zwrotowi jak i odliczeniu od podatku należnego, ponadto nie można go skompensować w postaci zmniejszenia zobowiązań z tytułu podatku dochodowego od osób prawnych. Dodaje się, iż organ podatkowy nie jest właściwy do zajęcia stanowiska w sprawie zaliczenia podatku VAT do kosztów kwalifikowanych refundowanych ze środków programu SAPARD.