Gmina X w okresie od 12.03.2003 r. do 01.06.2004 r. była czynnym zarejestrowanym podatnikiem podatku VAT, w okresie od 02.06.2004 r. do 31.10.2004 r. nie figurowała w ewidencji czynnych podatników podatku VAT w związku ze złożonym zgłoszeniem o zaprzestaniu wykonywania czynności podlegających opodatkowaniu podatkiem VAT; z dniem 1 listopada 2004 r. dokonała ponownej rejestracji do podatku VAT.

W ramach prowadzonej działalności statutowej zrealizowała inwestycję polegającą na modernizacji drogi gminnej X - Y w miejscowości Z. Poniesione wydatki obejmowały podatek VAT. Gmina nie prowadzi działalności gospodarczej w zakresie budowy dróg. W dniu 29.06.2004 r. została podpisana umowa z Agencją Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa o pomocy finansowej z funduszy Unii Europejskiej i funduszy krajowych - Program SAPARD o pomocy finansowej stanowiącej zwrot części kosztów kwalifikowanych poniesionych przez Gminę na realizację przedmiotowej inwestycji.

Na mocy przepisów art. 86 ust. 1 i art. 88 ust. 4 ustawy o podatku od towarów i usług z dnia 11 marca 2004 r. (Dz. U. Nr 54, poz. 535 ze zm.) prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego przysługuje jedynie podatnikom zarejestrowanym jako podatnicy VAT czynni i podatek ten podlega odliczeniu w zakresie, w jakim towary i usługi, z których nabyciem naliczono ten podatek, są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych podatkiem VAT.

Uwzględniając powyższe Gmina nie będąc czynnym zarejestrowanym podatnikiem VAT w okresie od 02.06.2004 r. do 31.10.2004 r. nie miała prawa do odliczenia podatku naliczonego związanego z prowadzoną inwestycją modernizacji drogi gminnej. Gmina jako zarejestrowany podatnik podatku VAT również nie ma prawa do odliczenia podatku VAT z tyt. prowadzonych inwestycji polegających na budowie bądź modernizacji dróg gminnych ponieważ jest to działalność statutowa Gminy i działalność taka nie podlega podatkowi VAT (art. 15 ust. 6 ustawy).

Ponadto § 27a rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 23 czerwca 2004 r. zmieniającego rozporządzenie w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 145, poz. 1541) daje możliwość zwrotu kwoty podatku naliczonego z tyt. nabycia towarów lub usług podmiotom, które przed dniem 1 maja 2004 r. zawarły z Agencją Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa umowy w ramach Specjalnego Programu Akcesyjnego na Rzecz Rozwoju Rolnictwa i Obszarów Wiejskich (SAPARD) dotyczące refundacji ze środków Unii Europejskiej części kosztów kwalifikowanych związanych z realizacją przedsięwzięć w ramach tego programu. W przypadku Gminy X przepis ten nie będzie miał zastosowania, ponieważ umowa z Agencją Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa w ramach specjalnego programu SAPARD została zawarta po 1 maja 2004 r., tj. 29.06.2004 r.