Zgodnie z § 23 ust. 1 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27 kwietnia 2004 r. w sprawie zwrotu podatku niektórym podatnikom, zaliczkowego zwrotu podatku, zasad wystawiania faktur, sposobu ich przechowywania oraz listy towarów i usług, do których nie mają zastosowania zwolnienia od podatku od towarów i usług (Dz. U. z 2004r Nr 97 poz. 971) zarejestrowanym podatnikom, którzy dokonują nabycia towarów i usług lub importu towarów za środki finansowe bezpośrednio im przekazane na odrębny rachunek bankowy, na którym są ulokowane wyłącznie środki bezzwrotnej pomocy zagranicznej, o których mowa w § 6 ust. 3 i 4, przysługuje zwrot podatku naliczonego.
Zwrot ten nie dotyczy kwot podatku naliczonego, o które został pomniejszony lub mógł być pomniejszony podatek należny, zgodnie z § 24 ust. 1 pkt 1 ww. rozporządzenia.

Zgodnie natomiast z § 6 ust. 3 i 4 powyższego rozporządzenia – za środki finansowe bezzwrotnej pomocy zagranicznej uważa się bezzwrotne środki przekazane polskim podmiotom z budżetu Unii Europejskiej na podstawie umów zawartych z Rządem Rzeczypospolitej Polskiej, dotyczących:
- Programu Pomocy w Przebudowie Gospodarczej Państw Europy Środkowej i Wschodniej (PHARE), w tym złotowe fundusze partnerskie powstałe w wyniku realizacji tego programu, a także środki, które zostały przekazane polskim podmiotom na podstawie umów zawartych z nimi przed 1 maja 2004r na sfinansowanie programów, realizowanych przez te jednostki w ramach Programów Ramowych Unii Europejskiej oraz w ramach innych programów wspólnotowych Unii Europejskiej,
- Kontraktów zawartych przed dniem 1 maja 2004 r. w ramach Przedakcesyjnego Instrumentu Polityki Rolnej (ISPA).

Biorąc pod uwagę powyższe należy stwierdzić, że jeżeli:
- środki otrzymane przez podatnika spełniają wymogi określone powyżej i mogą być uznane za środki finansowe bezzwrotnej pomocy zagranicznej,
- podatek naliczony przy nabyciu towarów i usług sfinansowanych z tych środków nie pomniejszył lub nie może pomniejszyć podatku należnego,
- podatnik spełnia warunki określone w przepisie zawartym w § 25 ust. 1 ww. rozporządzenia,
wówczas firmie przysługuje zwrot tego podatku naliczonego, na podstawie złożonego wniosku, zgodnie z § 27 ust. 1 powyższego rozporządzenia