Opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, zgodnie z art. 5 ust. 1 pkt 1 ustawy z dnia 11.03.2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535), podlegają odpłatna dostawa towarów i odpłatne świadczenie usług na terytorium kraju. Przez towary, w świetle ww. ustawy, rozumie się rzeczy ruchome, jak również wszelkie postacie energii, budynki i budowle lub ich części, będące przedmiotem czynności podlegających opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, które są wymienione w klasyfikacjach wydanych na podstawie przepisów o statystyce publicznej, a także grunty (por. art. 2 pkt 6 cyt. ustawy). W przypadku gdy przedmiotem dostawy są budynki lub budowle trwale z gruntem związane albo części takich budynków lub budowli, z podstawy opodatkowania nie wyodrębnia się wartości gruntu (art. 29 ust. 5 ustawy).Jeżeli dostawa dotyczy budynków i budowli lub ich części, a od końca roku, w którym zakończono budowę tych obiektów, minęło co najmniej 5 lat, lub pozostałych towarów, z wyjątkiem gruntów, których okres używania przez podatnika dokonującego ich dostawy wyniósł co najmniej pół roku, uznanych na podstawie art. 43 ust. 2 ww. ustawy za towary używane, dostawa towarów używanych na podstawie przepisu art. 43 ust. 1 pkt 2 ustawy z dnia 11.03.2004 r. podlega zwolnieniu od opodatkowania podatkiem VAT. Wobec powyższego, z uwagi na brzmienie przepisu art. 29 ust. 5 ww. ustawy, dostawa gruntu związanego z towarami używanymi korzysta ze zwolnienia od opodatkowania podatkiem od towarów i usług, bowiem całość transakcji dostawy podlega zwolnieniu od opodatkowania podatkiem VAT. Powyższe zasady obowiązują w przypadku gdy dostawie podlegają grunty objęte prawem własności.
Odmienną zupełnie kwestię stanowi opodatkowanie gruntów zabudowanych i niezabudowanych objętych prawem użytkowania wieczystego. Prawo użytkowania wieczystego gruntu jest innym prawem rzeczowym niż prawo własności. Zgodnie z przepisami o podatku dochodowym uznane jest za wartość niematerialną i prawną. Na podstawie przepisu art. 8 ust. 1 pkt 1 ustawy z dnia 11.03.2004 r. o podatku VAT przeniesienie praw do wartości niematerialnych i prawnych, bez względu na formę, w jakiej dokonano czynności prawnej traktowane jest jako świadczenie usług. Zatem sprzedaż prawa wieczystego użytkowania gruntu wraz ze związanymi z nim budynkami i budowlami stanowi czynność podlegającą opodatkowaniu podatkiem VAT o charakterze mieszanym, tj.: przeniesienie własności budynków i budowli trwale związanych z tym gruntem stanowi dostawę towarów (art. 7 ust. 1 ustawy), natomiast przeniesienie prawa użytkowania wieczystego gruntu stanowi świadczenie usług (art. 8 ust. 1 pkt 1 ustawy).Zgodnie z przepisami § 8 ust. 1 pkt 12 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27.04.2004 r. w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 97, poz. 970), wydanego na podstawie delegacji ustawowej zawartej w art. 82 ust. 3 ustawy z dnia 11.03.2004 r. o podatku od towarów i usług zwalnia się od podatku od towarów i usług zbycie prawa wieczystego użytkowania gruntu, w przypadku dostawy budynków lub budowli trwale z gruntem związanych albo części takich budynków lub budowli, jeżeli budynki te lub budowle albo ich części są zwolnione od podatku lub opodatkowane stawką podatku w wysokości 0%.
Biorąc pod uwagę ww. przepisy oraz stan faktyczny w przedmiotowej sprawie, tut. organ podatkowy podziela stanowisko Podatnika, iż dostawa budynków i budowli, będących towarami używanymi w rozumieniu art. 43 ust. 2 ww. ustawy, podlega przy wyczerpaniu przesłanek art. 43 ust. 6, zwolnieniu od podatku VAT. Jednocześnie potwierdza, iż sprzedaż gruntu objętego prawem użytkowania wieczystego, na którym posadowione są ww. budynki, również jest zwolniona od podatku VAT. Powyższe zwolnienie wynika bowiem z przepisu § 8 ust. 1 pkt 12 Rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27.04.2004 r.