Podatnik prowadzi działalność gospodarczą w zakresie usług budowlanych i transportowych, którą poszerzył o import i handel używanymi samochodami osobowymi i ciężarowymi.
Samochody osobowe są towarem handlowym przeznaczonym do sprzedaży, uważa więc iż przysługuje z tego tytułu odliczenie podatku VAT naliczonego wynikającego z dokumentów odprawy celnej SAD.
Ponadto zgodnie z § 67 ust. 9 Rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 22 marca 2002 r. odsprzedaż używanych samochodów osobowych, dokonywana przez podatników, którzy nie byli użytkownikami tych samochodów, jest zwolniona od podatku VAT w części przewyższającej kwotę podatku obliczoną od różnicy pomiędzy ceną sprzedaży a ceną nabycia samochodu.
Wątpliwości budzi odliczenie podatku VAT od samochodów osobowych, gdy zakup i sprzedaż nie zamyka się w czasie jednego miesiąca. Niekiedy może to trwać nawet kilka miesięcy, aż znajdzie się nabywca na sprowadzony samochód. Natomiast jeżeli rozliczy w deklaracji VAT-7 podatek naliczony od samochodu w danym miesiącu i nie ma jego sprzedaży, a pozostała jest opodatkowana w całości, to zgodnie ze wzorem deklaracji podatek naliczony od tego samochodu odlicza się w pełnej wysokości ,chociaż jego zakup służy sprzedaży częściowo opodatkowanej i zwolnionej ,a zatem powinien być odliczony tylko w części proporcjonalnie do sprzedaży opodatkowanej.
Natomiast w momencie sprzedaży samochodu osobowego, odliczeniu w części będą podlegały tylko wydatki kosztowe związane z tą sprzedażą, a nie jego faktyczny zakup.

Na mocy § 67 ust. 1 pkt 9 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 22 marca 2002 r. w sprawie wykonania niektórych przepisów o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym (Dz. U. Nr 27 poz. 268 ze zm.) odsprzedaż używanych samochodów osobowych oraz innych samochodów o ładowności do 500kg,dokonywana przez podatników podatku VAT, którzy nie byli użytkownikami tych samochodów jest zwolniona od podatku VAT w części przewyższającej kwotę podatku obliczoną od różnicy pomiędzy ceną sprzedaży a ceną nabycia samochodu.
W praktyce powyższe zwolnienie oznacza, iż jeżeli podatnik kupił używany samochód osobowy lub inny niż osobowy o ładowności nie przekraczającej 500kg,przy dalszej odsprzedaży obrotem opodatkowanym VAT wg stawki 22% jest kwota różnicy między ceną sprzedaży a ceną nabycia samochodu osobowego.
Podstawą opodatkowania podatkiem VAT jest różnica pomiędzy ceną sprzedaży wraz z podatkiem należnym a ceną nabycia wraz z podatkiem VAT. Od tej ustalonej podstawy opodatkowania wyliczoną rachunkiem „w stu” podatek należy zadeklarować jako podatek należny z tytułu dokonanej odsprzedaży.

Natomiast obrotem zwolnionym od podatku VAT jest kwota stanowiąca równowartość ceny nabycia tego samochodu, którą podatnik powinien zaewidencjonować i zadeklarować jako sprzedaż zwolnioną.
Zgodnie z art. 25 ust. 1 pkt 2 wyżej cytowanej ustawy obniżenia kwoty lub zwrotu różnicy podatku należnego nie stosuje się do nabywanych przez podatnika samochodów osobowych oraz innych o dopuszczalnej ładowności do 500kg,z wyjątkiem przypadków, gdy odsprzedaż lub używanie na podstawie umów leasingu tych samochodów stanowi przedmiot działalności gospodarczej podatnika.
Natomiast w odniesieniu do odliczenia podatku VAT ustawodawca określił je w art. 19 ust. 1 ustawy z dnia 8 stycznia 1993 r. o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym (j.t. Dz. U. Nr 11 poz. 50 ze zm) podatnik ma prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego przy nabyciu towarów i usług, związanych ze sprzedażą opodatkowaną w terminie „nie wcześniej niż w rozliczeniu za miesiąc w którym podatnik otrzymał fakturę albo dokument celny, i nie póź niej niż w rozliczeniu za miesiąc następny z zastrzeżeniem pkt 2 - 4.

Zatem ,należy zauważyć, iż nabywane przez podatnika samochody używane dotyczą w części sprzedaży opodatkowanej jak i w znacznej części zwolnionej. Należy podkreślić, że tą część podatku naliczonego, którą podatnik płaci w cenie nabycia samochodu, ma związek ze zwolnieniem przy sprzedaży tego samochodu, bowiem opodatkowana jest jedynie część dodanej do ceny nabycia marży, a więc biorąc pod uwagę art. 20 ust. 1 ustawy o VAT w brzmieniu ”podatnik dokonujący sprzedaży towarów opodatkowanych i zwolnionych od podatku obowiązany jest do odrębnego określenia kwot podatku naliczonego, związanego ze sprzedażą opodatkowaną i zwolnioną”, to należy uznać, iż należy go odrębnie do niej przyporządkować.
Następuje tu bowiem sprzedaż tego samego towaru, aczkolwiek w części zwolnionej, w części dodanej do ceny nabycia marży - opodatkowanej.Rozliczenie więc podatku naliczonego związanego z tą sprzedażą należy dokonać dwuetapowo, a więc:
- w miesiącu nabycia samochodu na podstawie otrzymanej faktury VAT lub dokumentu celnego nie odlicza się podatku VAT, chyba że w danym okresie rozliczeniowym nastąpi sprzedaż tego samochodu
- w przypadku sprzedaży w innym okresie rozliczeniowym niż miesiąc zakupu odliczenie podatku naliczonego dokonuje się poprzez złożenie korekty do miesiąca otrzymania dokumentu SAD, gdy już wiadomo jaka jest proporcja VAT naliczonego związanego z częścią opodatkowaną tzn. dotyczącą marży. Również można dokonać tego odliczenia w momencie otrzymania SAD-u z obliczonym podatkiem VAT od nabytego samochodu ,pod warunkiem ustalenia proporcji tj. udziału wartości marży w wartości sprzedaży ogółem, a przy ewentualnej zmianie ceny sprzedaży i powstaniu różnicy do odliczenia na plus lub minus powrócić poprzez złożenie korekty do miesiąca w którym dokonano pierwotnego odliczenia do konkretnego samochodu.
Podatek naliczony do odliczenia trzeba więc rozliczyć proporcjonalnie, w stosunku do udziału sprzedaży opodatkowanej w wartości sprzedaży ogółem konkretnego samochodu.
Należy nadmienić, że ten sposób odliczenia podatku naliczonego od należnej struktury sprzedaży będzie obowiązywał do 30.04.2004 r.