Na podstawie art.19 ust. 13 pkt 4 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług ( Dz.U. Nr 54, poz.535 ) obowiazek podatkowy w podatku VAT z tytułu świadczenia w kraju usług najmu powstaje z chwilą otrzymania całości lub części zapłaty, nie później jednak niż z upływem terminu płatności określonego w umowie lub fakturze. Jeżeli więc podatnik wynajmuje lokal użytkowy innemu podatnikowi, obowiazek podatkowy powstaje najpóźniej z upływem terminu płatności czynszu wynikajacego z umowy ( faktury), chyba że podatnik otrzymał zapłatę jeszcze przed tym terminem,gdyż wówczas obowiazek zaistnieje z chwilą otrzymania zapłaty.W art. 19 ust. 11 cytowanej wyżej ustawy postanowiono, że jeżeli przed wydaniem towaru lub wykonaniem usługi otrzymano częśc należności, w szczególności : przedpłatę, zaliczkę, zadatek, ratę, obowiązek podatkowy powstaje z chwilą jej otrzymania w tej części.Stosownie do § 18 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27 kwietnia 2004 r.w sprawie zwrotu podatku niektórtm podatnikom, zaliczkowego zwrotu podatku,zasad wystawiania faktur, sposobu ich przechowywania oraz listy towarów i usług, do których nie mają zastosowania zwolnienia od podatku od towarów i usług ( Dz.U. Nr 97,poz.971 ) w przypadkach określonych w art. 19 ust. 10 i ust. 13 pkt 1 – 5, 7-11 ustawy, fakturę wystawia się nie później niż z chwilą powstania obowiązku podatkowego. Faktury, w tych przypadkach nie mogą być jednak wystawione wcześniej niż 30 dnia przed powstaniem obowiązku podatkowego.Jeżeli przed wydaniem towaru lub wykonaniem usługi otrzymano część lub całość należności , w szczególności : przedpłatę , zaliczke, fakturę wystawia się nie później niż siódmego dnia od dnia, w którym otrzymano część lub całość należności od nabywcy.Zatem jeżeli faktury dokumentujące pobranie zaliczki nie obejmują całej ceny brutto, sprzedawca po wydaniu towaru lub wykonaniu usługi ma obowiazek wystawić fakturę na zasadach ogólnych, z tym że sumę wartości towarów ( usług ) pomniejsza sie o wartość otrzymanych części należności, a kwotę podatku pomniejsza się o sumę kwot podatku wykazanego w fakturach dokumentujących pobranie częśći należności. Taka faktura powinna również zawierać numery faktur wystawionych przed wydaniem towaru lub wykonaniem usługi.Jeżeli faktury dokumentujące otrzymanie należności obejmują całą cenę brutto towaru lub usługi, sprzedawca po wydaniu towaru lub wykonaniu usługi nie wystawia fakturyw terminie określonym na zasadach ogólnych.